More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05790 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  82.58 
 
 		 132 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  78.79 
 
 		 132 aa  222  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  73.48 
 
 		 132 aa  209  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  71.97 
 
 		 132 aa  204  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  70.54 
 
 		 130 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  68.94 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  69.23 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  173  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  60 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  60.47 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 133 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  54.96 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 129 aa  141  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  51.94 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  136  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  50.39 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>