More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2219 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  77.44 
 
 		 133 aa  221  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  77.44 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 133 aa  216  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  78.2 
 
 		 133 aa  216  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  72.93 
 
 		 133 aa  213  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  69.92 
 
 		 133 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  67.67 
 
 		 133 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  69.17 
 
 		 133 aa  200  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  67.67 
 
 		 133 aa  199  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 		 133 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 		 133 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  68.42 
 
 		 133 aa  196  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  67.67 
 
 		 133 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  60.9 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  64.12 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  59.56 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  56.72 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 133 aa  157  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  58.96 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 134 aa  153  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  56.2 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  56.62 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  54.89 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  149  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  149  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>