More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4928 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
132 aa  269  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  70.45 
 
 
132 aa  202  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  67.69 
 
 
130 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  64.66 
 
 
133 aa  184  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
134 aa  161  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  157  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  157  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  156  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  56.92 
 
 
134 aa  153  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 
133 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
133 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 
132 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  151  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
133 aa  151  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 
130 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
131 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
131 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
131 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 
132 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  147  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  147  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  49.23 
 
 
131 aa  147  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
131 aa  147  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  55.73 
 
 
131 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  147  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  51.88 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  50.37 
 
 
135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>