More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1171 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  96.92 
 
 		 132 aa  259  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  80.15 
 
 		 133 aa  221  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  67.69 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  65.12 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  60 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  58.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  56.72 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 133 aa  153  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  55.47 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  55.47 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  56.25 
 
 		 132 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.69 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  54.96 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  57.81 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  146  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>