More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3716 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  273  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  78.2 
 
 		 133 aa  222  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  77.44 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  85.71 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  85.71 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  76.69 
 
 		 133 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  76.69 
 
 		 133 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 133 aa  214  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  190  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  188  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 		 133 aa  183  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 133 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 133 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  61.24 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  54.89 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  149  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  54.14 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  51.88 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  53.62 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  54.55 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>