More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0239 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  85.71 
 
 
133 aa  238  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 
133 aa  218  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 
133 aa  216  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 
133 aa  215  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 
133 aa  209  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  72.93 
 
 
133 aa  206  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 
133 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 
133 aa  183  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 
133 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
133 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
133 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 
133 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
133 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
133 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  163  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  56.15 
 
 
131 aa  157  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  60.47 
 
 
131 aa  157  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  54.89 
 
 
132 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  55.97 
 
 
133 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
131 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  153  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 
130 aa  151  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
130 aa  150  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  51.91 
 
 
134 aa  147  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
131 aa  147  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
133 aa  146  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
131 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 
130 aa  144  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 
132 aa  144  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  51.47 
 
 
136 aa  145  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  143  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  143  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  143  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 
135 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
129 aa  141  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  48.87 
 
 
132 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  140  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  48.51 
 
 
132 aa  141  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  48.12 
 
 
132 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 
132 aa  140  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  140  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  140  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  52.27 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  49.24 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  46.62 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  48.87 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
131 aa  137  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  44.19 
 
 
132 aa  137  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>