More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16651 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  272  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  91.73 
 
 
133 aa  255  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  88.72 
 
 
133 aa  251  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  89.47 
 
 
133 aa  250  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  87.12 
 
 
133 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  86.36 
 
 
133 aa  240  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  84.21 
 
 
133 aa  240  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  84.21 
 
 
133 aa  239  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  83.46 
 
 
133 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  82.71 
 
 
133 aa  235  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  67.67 
 
 
133 aa  200  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 
133 aa  193  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  64.66 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 
133 aa  190  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 
133 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  52.9 
 
 
136 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  146  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  50.76 
 
 
131 aa  146  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  53.38 
 
 
132 aa  146  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  146  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  55.04 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 
133 aa  142  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
131 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
131 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
130 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000574269  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  49.62 
 
 
132 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
135 aa  140  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  140  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  140  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 
131 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  140  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  140  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 
132 aa  140  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  48.87 
 
 
132 aa  140  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
130 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0334  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  140  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  48.53 
 
 
136 aa  139  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  139  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  52.71 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  51.09 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  137  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  45.86 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  48.12 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>