More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0729 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  63.64 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  65.12 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  161  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  60 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  157  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  55.97 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  54.55 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  53.44 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  54.69 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000362987  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>