More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1968 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  95.49 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  88.72 
 
 		 133 aa  251  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  89.47 
 
 		 133 aa  246  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  87.88 
 
 		 133 aa  243  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  87.12 
 
 		 133 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  81.95 
 
 		 133 aa  239  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  81.2 
 
 		 133 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  80.45 
 
 		 133 aa  236  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  80.45 
 
 		 133 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  69.17 
 
 		 133 aa  200  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  66.92 
 
 		 133 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  66.17 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  56.2 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000574269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0334  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  54.55 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  52.63 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000362987  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  49.26 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>