More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3991 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  53.38 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.89 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  50.76 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  52.27 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  52.67 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>