More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77100 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  100 
 
 		 130 aa  270  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  100 
 
 		 130 aa  270  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  80 
 
 		 130 aa  226  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  76.15 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  71.54 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  67.69 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  51.61 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  51.61 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  49.19 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  46.62 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  39.23 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  41.54 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  40.77 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  38.46 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  38.46 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  38.46 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  33.09 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  29.41 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  26.76 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  30.22 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  26.06 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  30.71 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  31.54 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  31.54 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.88 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  32.39 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  29.79 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  28.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  26.06 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  29.08 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  24.65 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  24.65 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0615  ribosomal protein S8  27.21 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  28.36 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  29.5 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  29.5 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  29.13 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  27.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  25.35 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  25.35 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  25.17 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>