More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0095 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  77.69 
 
 		 130 aa  219  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  64.34 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  58.46 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  56.92 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  57.14 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  57.94 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  55.56 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  160  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  53.97 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  53.97 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  55.04 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  52.31 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  50.77 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  50.77 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  48.46 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  49.23 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  46.92 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  47.37 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  36.17 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  31.58 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  35.61 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  35.61 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  33.57 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  34.51 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  29.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  31.85 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  28.57 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  30.6 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  31.06 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  27.97 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  31.94 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  34.97 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  27.48 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  32.39 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  29.85 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>