More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2238 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  63.85 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  64.62 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  61.54 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  51.97 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  48.41 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  47.24 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  43.65 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  41.27 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  39.23 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  39.23 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  39.23 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  40.77 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  40 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  39.23 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  36.92 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  36.92 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  44.78 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  31.39 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  36.03 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  33.82 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  34.31 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  32.61 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  32.56 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  30.41 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  30.23 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  31.39 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  27.07 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  31.72 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  27.91 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  28.68 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.23 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  30.08 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  29.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  29.46 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  27.82 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  28.47 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  26.32 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  28.68 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  30.88 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  29.29 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  32.35 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  30.88 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  28.47 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  30.23 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  27.01 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  29.2 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  27.69 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  28.79 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  28.68 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>