More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0547 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  269  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  75.38 
 
 		 130 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  71.54 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  66.15 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  64.62 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  55.91 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  51.59 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  47.69 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  47.69 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  45.38 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  48.03 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  43.08 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  43.08 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  43.08 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.08 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  43.61 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  34.88 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  35.82 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  35.21 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  31.85 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  36.15 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  36.84 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  33.08 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  35.82 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  34.59 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  36.36 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  36.36 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  37.69 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  34.59 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  35.88 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  35.82 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  31.34 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  34.53 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  32.09 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  35.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  34.59 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  34.59 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  32.56 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  32.39 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  32.84 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  29.86 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  34.81 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  29.86 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>