More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2307 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  82.31 
 
 		 130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  83.85 
 
 		 130 aa  231  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  84.62 
 
 		 130 aa  229  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  83.85 
 
 		 130 aa  228  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  58.46 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  55.56 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  49.21 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  46.03 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  43.65 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  46.03 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  41.13 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  38.46 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  38.46 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.55 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  37.69 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  35.38 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  38.35 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  35.34 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  31.16 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  33.57 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  34.53 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  30.08 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  32.87 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  31.85 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  35.25 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  37.5 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  31.94 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  32.14 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  36.76 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  32.56 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  28.36 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  30.94 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  34.31 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  30.22 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  32.14 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  31.25 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  29.93 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  34.56 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  36.43 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  35.51 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0334  30S ribosomal protein S8  31.25 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000103559  hitchhiker  0.000409506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  30 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  32.84 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  31.11 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0598  30S ribosomal protein S8  30.41 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0508893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  29.2 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>