More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1763 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  80.45 
 
 		 133 aa  235  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  53.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  52.63 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  53.03 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  51.88 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  51.88 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  52.63 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  49.62 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  50.38 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  46.62 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  46.62 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  46.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  46.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  48.12 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  44.36 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  45.11 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  44.36 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  44.36 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  44.19 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  44.36 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  43.61 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  44.96 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  42.11 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  39.85 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  41.35 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  39.1 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  37.59 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  35.34 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  33.57 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  34.81 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  34.81 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  34.07 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  32.14 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  34.75 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  34.29 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  32.14 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  31.91 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 133 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  34.06 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  33.82 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  33.79 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  36.03 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  30.66 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  28.78 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  31.91 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  32.14 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>