More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0457 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  75.38 
 
 		 130 aa  212  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  67.69 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  63.85 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  63.85 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  57.94 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  53.97 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  49.22 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  51.59 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  45.38 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  45.38 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  43.08 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  44.62 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  43.85 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  42.31 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  43.08 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  42.31 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  34.78 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  32.09 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  34.51 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  33.8 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  35.25 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  34.06 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  33.1 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  34.03 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  32.62 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  31.11 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  32.39 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.6 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  29.77 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  34.09 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  34.09 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  28.67 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  32.56 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  32.61 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  27.97 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  32.84 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  34.62 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  32.39 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  29.86 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0440  30S ribosomal protein S8  32.84 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106924  hitchhiker  0.0000987465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  29.85 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  34.31 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  27.54 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  29.5 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  32.61 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  32.61 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  30.08 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  27.97 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  29.1 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  35.07 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>