More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2282 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 131 aa  260  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 131 aa  224  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 131 aa  224  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  80.77 
 
 		 131 aa  223  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000186287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  79.23 
 
 		 131 aa  221  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  77.69 
 
 		 131 aa  215  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2050  30S ribosomal protein S8  81.68 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00419842  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.15 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  49.22 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 132 aa  123  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  48.09 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  49.61 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  48.44 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  50 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  46.88 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  46.56 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  48.85 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  44.53 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  47.66 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  46.09 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  46.88 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  44.7 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  48.44 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  46.03 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000012409  unclonable  0.0000000000562401 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  43.75 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  45.31 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  48.82 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2358  ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0341  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.498825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  43.65 
 
 		 133 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2310  ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000043435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 189 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  43.75 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0511  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0171606  hitchhiker  0.000000000407923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>