More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0164 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  99.23 
 
 
130 aa  266  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  98.46 
 
 
130 aa  264  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  94.62 
 
 
130 aa  253  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  83.85 
 
 
130 aa  233  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  60.77 
 
 
130 aa  177  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  56.92 
 
 
130 aa  169  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  57.94 
 
 
129 aa  167  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  54.69 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
130 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
130 aa  153  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 
130 aa  152  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  53.08 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 
130 aa  150  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 
130 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  52.34 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 
130 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 
130 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 
130 aa  140  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  43.85 
 
 
130 aa  130  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  43.85 
 
 
130 aa  130  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  46.62 
 
 
133 aa  128  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  45.11 
 
 
133 aa  124  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 
130 aa  123  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.54 
 
 
130 aa  120  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  41.54 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  40.77 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  41.13 
 
 
130 aa  117  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 
130 aa  117  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  32.33 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  34.31 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  33.08 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  31.88 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  31.69 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  32.62 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  32.12 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  34.09 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  32.06 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  33.57 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  31.62 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  31.58 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  32.14 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  29.5 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  36.43 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  31.43 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  36.43 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  31.91 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  30.6 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  30.99 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  32.87 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  29.5 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  31.43 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>