233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23691 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  71.54 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  71.54 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  71.54 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  70 
 
 		 130 aa  195  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  67.69 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  49.61 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  46.46 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 133 aa  130  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  45.16 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  45.11 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  40.77 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  40 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  34.62 
 
 		 130 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  35.38 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  35.38 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  36.15 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  35.38 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  32.37 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  26.06 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  29.23 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  30.22 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  29.41 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  28.89 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  29.5 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0615  ribosomal protein S8  29.55 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  30.15 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  25.74 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf428  ribosomal protein S8  27.07 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  31.78 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  29.55 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  30.3 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  30.3 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101428  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  27.21 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  29.55 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  30.3 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  27.27 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  29.1 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  27.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  26.87 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  28.79 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  25.69 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  28.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  30.88 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  29.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  30.6 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  26.87 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  26.06 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4530  30S ribosomal protein S8  29.55 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000014022  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  28.03 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000362987  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>