More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1749 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  70.77 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  66.92 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  67.69 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  66.92 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  57.69 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  58.14 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  54.26 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  53.08 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  53.08 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  54.62 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  58.73 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  54.14 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  47.69 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  50 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  46.92 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  30.94 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  29.63 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  30.94 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  29.08 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  31.25 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  26.76 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  30.56 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  28.78 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  28.78 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101428  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  28.78 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  29.79 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  30.22 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  29.79 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  28.87 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  29.79 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  29.58 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  27.46 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  31.21 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  28.06 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1932  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  28.06 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  27.34 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  29.17 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>