More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0579 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  267  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  71.54 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  67.69 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  66.92 
 
 		 130 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  61.54 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  59.06 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  48.41 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  47.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  47.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  46.83 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  47.69 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  50.39 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.62 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  46.03 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  43.85 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  43.08 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  38.35 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  37.21 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  33.83 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  36.09 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  36.09 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  36.84 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  35 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  34.85 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  35.61 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  35.61 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  36.84 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  37.12 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  37.98 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  31.78 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2358  ribosomal protein S8  37.5 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  30.23 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  35.04 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  34.29 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  34.59 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  32.06 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  32.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  29.32 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  34.56 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  35.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  31.01 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  35.04 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  32.85 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>