More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0225 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  97.69 
 
 
130 aa  263  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  86.92 
 
 
130 aa  240  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  83.08 
 
 
130 aa  233  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  84.62 
 
 
130 aa  229  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  59.23 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 
130 aa  153  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 
130 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 
130 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  52.38 
 
 
129 aa  152  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  52.31 
 
 
130 aa  150  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
129 aa  147  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 
130 aa  141  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
130 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 
130 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 
130 aa  127  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  46.83 
 
 
129 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  41.54 
 
 
130 aa  122  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  41.54 
 
 
130 aa  122  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  39.23 
 
 
130 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.62 
 
 
130 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  40 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  40 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  40 
 
 
130 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  39.1 
 
 
133 aa  110  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  40.6 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  36.15 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  33.83 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  35.56 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 
132 aa  76.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  30.6 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  34.78 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  33.58 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  32.61 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  34.06 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  34.06 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  31.85 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  29.71 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  28.99 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  36.5 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  30.77 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  31.88 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  33.81 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  32.86 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  31.54 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  30.94 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  35.56 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  29.2 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  31.94 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  32.64 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  29.77 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  30.66 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  31.65 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  28.15 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  30.6 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  32.61 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  32.37 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  28.68 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  30.6 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  31.72 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  32.37 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  33.81 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  0.0000000067379 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>