More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0277 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
136 aa  273  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
132 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
132 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
132 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  49.63 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 
133 aa  144  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
133 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 
132 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0279  ribosomal protein S8  51.11 
 
 
136 aa  140  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000272421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  53.33 
 
 
133 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  53.68 
 
 
131 aa  139  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  51.82 
 
 
134 aa  139  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  51.85 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
130 aa  137  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  52.24 
 
 
130 aa  137  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  52.21 
 
 
131 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  50.36 
 
 
134 aa  137  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 
132 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  53.33 
 
 
132 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  137  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
133 aa  135  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  45.19 
 
 
132 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  52.21 
 
 
126 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  47.41 
 
 
135 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  49.26 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  48.89 
 
 
131 aa  133  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  46.67 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  51.49 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  52.94 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  51.82 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  51.82 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  48.53 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000012409  unclonable  0.0000000000562401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  48.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  49.26 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  48.51 
 
 
131 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  48.91 
 
 
134 aa  130  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  45.93 
 
 
135 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 
131 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  48.53 
 
 
132 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  49.64 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  45.93 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  46.32 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  46.67 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  47.45 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  48.51 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  45.19 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  48.51 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  47.06 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2310  ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000043435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  44.12 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>