More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0065 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.88 
 
 
308 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.22 
 
 
304 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  60.78 
 
 
304 aa  378  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.4 
 
 
298 aa  350  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.05 
 
 
298 aa  348  5e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.72 
 
 
298 aa  348  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  54.43 
 
 
308 aa  334  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.33 
 
 
302 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  54.42 
 
 
317 aa  330  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
303 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.75 
 
 
302 aa  329  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.64 
 
 
305 aa  324  9e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.03 
 
 
304 aa  323  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
305 aa  321  9.000000000000001e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.82 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55 
 
 
302 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52 
 
 
313 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
305 aa  301  8.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  48.84 
 
 
311 aa  301  9e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
306 aa  300  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
304 aa  293  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.2 
 
 
304 aa  291  8e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  49.35 
 
 
2333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  46.41 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
315 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
309 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
321 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
310 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
307 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  48.51 
 
 
309 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  46.05 
 
 
359 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.73 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.75 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.36 
 
 
311 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
311 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
311 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
311 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
311 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
307 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  46 
 
 
2211 aa  266  4e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
330 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  46.05 
 
 
303 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
311 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.85 
 
 
304 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  43.34 
 
 
2275 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  46.86 
 
 
341 aa  256  3e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  48.12 
 
 
312 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.19 
 
 
298 aa  247  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  42.86 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  41.8 
 
 
431 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  41.8 
 
 
431 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.53 
 
 
320 aa  243  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  42.54 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4730  aspartate carbamoyltransferase  41.35 
 
 
430 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  0.148121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  41.96 
 
 
334 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  40.95 
 
 
339 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0063  aspartate carbamoyltransferase  42.39 
 
 
343 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.631606  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  41.16 
 
 
431 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  41.16 
 
 
431 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  41.16 
 
 
431 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  40.82 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  42.52 
 
 
411 aa  239  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  44.15 
 
 
355 aa  239  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0197  aspartate carbamoyltransferase  40.32 
 
 
431 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1605  aspartate carbamoyltransferase  40.32 
 
 
431 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1687  aspartate carbamoyltransferase  40.32 
 
 
431 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  40.84 
 
 
431 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2108  aspartate carbamoyltransferase  41.67 
 
 
430 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0801752  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  40.84 
 
 
431 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  41.59 
 
 
339 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  40.51 
 
 
431 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5900  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 
430 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  40 
 
 
339 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5513  aspartate carbamoyltransferase  39.74 
 
 
431 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  39.68 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  40 
 
 
339 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  39.37 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  40.63 
 
 
339 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  40.32 
 
 
339 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000646707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  40.32 
 
 
339 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  40 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  40 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>