More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03647 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 321 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  97.09 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.9 
 
 		 330 aa  577  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.11 
 
 		 309 aa  558  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.82 
 
 		 311 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.17 
 
 		 311 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.01 
 
 		 310 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.17 
 
 		 311 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.23 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.84 
 
 		 311 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.16 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 311 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.84 
 
 		 311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.84 
 
 		 311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  64.08 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  54.1 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.14 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 		 303 aa  299  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 		 307 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.2 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.67 
 
 		 298 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  45.74 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.01 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.83 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.89 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  43.77 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  40.45 
 
 		 2211 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  39.48 
 
 		 2333 aa  240  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1305  aspartate carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  41.4 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  39.14 
 
 		 2275 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1821  aspartate carbamoyltransferase  42.51 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  39.81 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  39.17 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  38.12 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  39.17 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  38.12 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4628  aspartate carbamoyltransferase  40.45 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  38.85 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  38.12 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  39.17 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  39.37 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  38.22 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.72 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  38.54 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  39.17 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25183  predicted protein  38.44 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181735  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  37.11 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>