More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3749 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 		 311 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.18 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.18 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.18 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.18 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  94.86 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  91.26 
 
 		 310 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.46 
 
 		 311 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.57 
 
 		 311 aa  564  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.21 
 
 		 311 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.21 
 
 		 311 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.21 
 
 		 311 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.89 
 
 		 311 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.89 
 
 		 311 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  83.28 
 
 		 311 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  76.05 
 
 		 341 aa  496  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.87 
 
 		 330 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  71.52 
 
 		 309 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.9 
 
 		 309 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.13 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.23 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 308 aa  278  6e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  45.22 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.45 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.53 
 
 		 305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.67 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.7 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.58 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.74 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  44.7 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  42.17 
 
 		 2211 aa  238  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  41.69 
 
 		 2333 aa  233  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  42.81 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  40.5 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  40.5 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  40.5 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  40.63 
 
 		 339 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  40.19 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  38.72 
 
 		 2275 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1821  aspartate carbamoyltransferase  44.4 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  40.71 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  40.13 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  40.38 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1305  aspartate carbamoyltransferase  44.57 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  39.68 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  40.13 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  39.69 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  40.71 
 
 		 354 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.26 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  39.75 
 
 		 337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25183  predicted protein  42.45 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  39.43 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  36.88 
 
 		 431 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  36.88 
 
 		 431 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  36.56 
 
 		 431 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  36.39 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5513  aspartate carbamoyltransferase  41.13 
 
 		 431 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  36.25 
 
 		 431 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  36.56 
 
 		 431 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  36.56 
 
 		 431 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  36.56 
 
 		 431 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>