44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0057 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  724    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  61.56 
 
 
346 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 
313 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
334 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  42.94 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 
358 aa  242  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.71 
 
 
366 aa  238  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 
328 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.12 
 
 
364 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.4 
 
 
365 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
355 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  39.5 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 
328 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  33.84 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.07 
 
 
328 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.48 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 
436 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 
442 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  24.04 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  21.8 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  23.59 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  20.77 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  23.59 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  22.71 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  20.56 
 
 
300 aa  46.2  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  23.19 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  21.25 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  23.42 
 
 
563 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  20.59 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  20.67 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.12 
 
 
514 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  20.29 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  21.05 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  22.4 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  21.37 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  23.37 
 
 
305 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  21.79 
 
 
338 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>