27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0342 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
355 aa  724    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  76.62 
 
 
355 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  76.06 
 
 
355 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  76.06 
 
 
355 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  64.23 
 
 
358 aa  474  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  37.24 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  36.07 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 
334 aa  209  7e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 
313 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 
358 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.29 
 
 
364 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 
328 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.53 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.01 
 
 
365 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 
358 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  33.14 
 
 
324 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  30.29 
 
 
329 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.07 
 
 
328 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.24 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  20.66 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  19 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  18.99 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  21.43 
 
 
666 aa  44.3  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>