23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1373 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 364 aa  754    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  79.18 
 
 		 365 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  78.69 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  74.18 
 
 		 358 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  75.55 
 
 		 358 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  38.71 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  39.12 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  37.82 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  36.26 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  38.12 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  37.06 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.03 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.28 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>