43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1428 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 358 aa  740    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  77.81 
 
 		 365 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  77.93 
 
 		 358 aa  585  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  75.96 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  75.82 
 
 		 364 aa  568  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  40.35 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 334 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  40.35 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  37.39 
 
 		 329 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  39.58 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  38.02 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.06 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.55 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  25.53 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.53 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  26.7 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  25 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  25.76 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  23.56 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  21.51 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  25.13 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  21.94 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>