30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1266 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  54.83 
 
 
328 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  57.94 
 
 
328 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.49 
 
 
328 aa  346  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  48.77 
 
 
329 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 
313 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  42.55 
 
 
346 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  39.5 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 
358 aa  212  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  35 
 
 
334 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  38.02 
 
 
358 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.12 
 
 
364 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.83 
 
 
365 aa  198  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.96 
 
 
366 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 
358 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 
355 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
355 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
355 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.3 
 
 
325 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  28.24 
 
 
563 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  27.14 
 
 
541 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.14 
 
 
541 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
726 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  25.9 
 
 
541 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  23.35 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
844 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>