51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0822 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 334 aa  690    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  42.68 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  39.88 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  39.18 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.71 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.78 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.73 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  36.48 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 355 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  36.16 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 355 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  35 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.2 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.38 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 436 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  22.53 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  25 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 291 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  24.45 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  22.51 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  19.72 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.22 
 
 		 609 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  24.49 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  24.56 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  22.01 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  24.26 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  22.78 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  22.57 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  23.5 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  22.49 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  21.8 
 
 		 541 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  21.49 
 
 		 541 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 647 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 609 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>