45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2174 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 358 aa  742    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  76.23 
 
 		 366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  77.93 
 
 		 358 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  74.52 
 
 		 365 aa  564  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.8 
 
 		 364 aa  557  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  42.68 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  40.92 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  42.94 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  37.61 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 328 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  37.43 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.58 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.55 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.14 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  23.38 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  25.32 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  26.32 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.17 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  22.47 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  22.41 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  23.28 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  22.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  26.18 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  21.74 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  28.88 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.71 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  23.71 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>