27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0580 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  731    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  94.37 
 
 		 355 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  94.93 
 
 		 355 aa  705    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  76.06 
 
 		 355 aa  585  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  64.23 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  38.22 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  35.36 
 
 		 346 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.05 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.11 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.96 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  30.88 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.3 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.71 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  19.31 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1451  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.050471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>