147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1451 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1451  Radical SAM domain protein  100 
 
 
313 aa  644    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.050471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  34.18 
 
 
310 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  33.12 
 
 
311 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  33.76 
 
 
331 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  33.65 
 
 
316 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  31.01 
 
 
305 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  30.99 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  32.92 
 
 
306 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  29.87 
 
 
311 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  32.91 
 
 
304 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  31.75 
 
 
321 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  31.58 
 
 
307 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  32.15 
 
 
307 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  29.06 
 
 
313 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  31.82 
 
 
311 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  31.82 
 
 
311 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  28.4 
 
 
314 aa  155  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  31.11 
 
 
311 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  31.01 
 
 
305 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  28.31 
 
 
317 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  32.53 
 
 
319 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.56 
 
 
316 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  31.09 
 
 
351 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  28.66 
 
 
319 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  27.41 
 
 
320 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  28.66 
 
 
319 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  28.05 
 
 
319 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  28.35 
 
 
319 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  28.35 
 
 
319 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  28.05 
 
 
319 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  28.05 
 
 
319 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  28.05 
 
 
319 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  28.05 
 
 
319 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  28.05 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  28.44 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  30.87 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  28.75 
 
 
319 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  28.35 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  28.35 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  29.38 
 
 
311 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  29.11 
 
 
311 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  32.7 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  28.94 
 
 
319 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  28.62 
 
 
319 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  26.14 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  28.21 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  27.08 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  29.78 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  31.23 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  30.16 
 
 
309 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.92 
 
 
318 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  29.47 
 
 
309 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  30.65 
 
 
308 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  30.03 
 
 
313 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  29.47 
 
 
309 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  29.47 
 
 
309 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  29.45 
 
 
314 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  30.72 
 
 
304 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  30.42 
 
 
312 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  30.58 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  29.7 
 
 
319 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  30.14 
 
 
309 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  28.21 
 
 
372 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  30.24 
 
 
309 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  30.03 
 
 
314 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  27.62 
 
 
316 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  28.47 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  28.08 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  28.47 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  30.57 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  31.76 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.22 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  31.44 
 
 
293 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2223  hypothetical protein  30.84 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.25 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.94 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  29.25 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  29.56 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.94 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  29.25 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  29.25 
 
 
309 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  27.94 
 
 
327 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  27.24 
 
 
317 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.49 
 
 
332 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  29.65 
 
 
334 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  28.66 
 
 
332 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  27.68 
 
 
312 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.3 
 
 
332 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  29.97 
 
 
303 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  29.97 
 
 
303 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  28.08 
 
 
328 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  28.23 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>