66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0046 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  734    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  64.23 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  64.51 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  63.38 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  64.23 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  36.08 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  34.67 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.88 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.51 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.6 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.06 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  32.46 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.98 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  25 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  21.84 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  21.57 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  21.46 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  21.79 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  20.29 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  20.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  20.29 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  19.12 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  20.38 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  20.38 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  19.91 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  19.91 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  21.79 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  21.33 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  23.13 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  19.91 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  20.14 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  20.38 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  19.81 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  19.81 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  19.81 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  20.38 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  19.81 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  19.81 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  23.12 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2416  hypothetical protein  30.21 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000874151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  19.9 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  19.91 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  23.32 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  19.32 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  18.79 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  17.47 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>