25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0961 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 436 aa  904    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  65.05 
 
 		 442 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 358 aa  87.4  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 334 aa  67  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  23.99 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  23.96 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  28.03 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  21.31 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  35 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  24.11 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  30 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.1 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0766  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.17 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0410499  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  20.41 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>