54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1179 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  61.56 
 
 		 347 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  46.27 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  40.92 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  42.55 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  43.43 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.62 
 
 		 365 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.22 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.82 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  34.88 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 		 355 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.46 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.62 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  26.17 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  23.27 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.27 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  25.35 
 
 		 666 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.57 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  24.8 
 
 		 522 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  22.97 
 
 		 541 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  23.62 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  23.32 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  24.53 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  22.97 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  22.97 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 732 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  22.3 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  22.3 
 
 		 541 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  26.49 
 
 		 530 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  24.04 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.4 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  24.53 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  30.89 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>