35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1409 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 328 aa  682    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  58.23 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  57.62 
 
 		 328 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  54.49 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  46.75 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  38.46 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  39.58 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  37.07 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.61 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.39 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.26 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  31.12 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.5 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  20.83 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  24.46 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 436 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.1 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  26.53 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  29.41 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 471 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  25.97 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  21.53 
 
 		 527 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  28.24 
 
 		 666 aa  42.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>