46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1151 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  46.27 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  43.64 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  42.24 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  38.37 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  43.38 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.21 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.14 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.48 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.06 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 355 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.23 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1969  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  22.7 
 
 		 527 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  21.99 
 
 		 436 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2258  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  23.53 
 
 		 541 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  27.43 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  23.53 
 
 		 541 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  23.78 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  24.22 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  22.54 
 
 		 473 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.16 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  22.79 
 
 		 541 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  28.23 
 
 		 555 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>