28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2957 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  653    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  46.96 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  31.92 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.9 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  20.78 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  26.75 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.28 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.86 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.79 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  26.78 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  19 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  25.41 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  23.05 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.8 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.59 
 
 		 608 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  26.05 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>