More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0058 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  100 
 
 		 304 aa  609  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  78.03 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  70.76 
 
 		 302 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  68.2 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  68.85 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  67.87 
 
 		 305 aa  427  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  67.54 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  66.67 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  67.97 
 
 		 305 aa  401  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  65.03 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  66.67 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  64.71 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  53.02 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  53.21 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  53.21 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  53.21 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  52.06 
 
 		 511 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  52.88 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  52.88 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.41 
 
 		 510 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  52.7 
 
 		 512 aa  300  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  50.16 
 
 		 511 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  50.79 
 
 		 507 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  49.68 
 
 		 501 aa  295  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  49.68 
 
 		 510 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  49.68 
 
 		 501 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.87 
 
 		 511 aa  294  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  49.36 
 
 		 516 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  48.57 
 
 		 512 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  49.04 
 
 		 516 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  49.36 
 
 		 512 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.72 
 
 		 510 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  49.04 
 
 		 510 aa  288  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  50.16 
 
 		 507 aa  288  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  49.21 
 
 		 516 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  47.94 
 
 		 515 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  47.94 
 
 		 512 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  49.04 
 
 		 517 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  47.94 
 
 		 512 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  47.94 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  47.94 
 
 		 515 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  47.94 
 
 		 515 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  47.94 
 
 		 515 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  50.48 
 
 		 531 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  49.04 
 
 		 516 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  47.78 
 
 		 511 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  47.62 
 
 		 512 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  48.41 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  47.77 
 
 		 523 aa  285  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  48.57 
 
 		 512 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  49.36 
 
 		 509 aa  285  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  48.15 
 
 		 528 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  48.9 
 
 		 507 aa  285  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  48.23 
 
 		 519 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  48.3 
 
 		 528 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  51.16 
 
 		 513 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  49.83 
 
 		 507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.36 
 
 		 510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  47.3 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  48.3 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  47.81 
 
 		 528 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  47.68 
 
 		 528 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  50.84 
 
 		 517 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  47.77 
 
 		 508 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  48.3 
 
 		 575 aa  281  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16720  GMP synthase, glutamine-hydrolyzing, C-terminal domain or B subunit  49.19 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  48.44 
 
 		 528 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  48.41 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  47.92 
 
 		 518 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  48.57 
 
 		 533 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  46.52 
 
 		 514 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  46.52 
 
 		 514 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  48.57 
 
 		 517 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  48.24 
 
 		 518 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  47.81 
 
 		 528 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  48.24 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  49.06 
 
 		 548 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  47.92 
 
 		 518 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  47.12 
 
 		 520 aa  279  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  48.25 
 
 		 524 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  48.25 
 
 		 524 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  50.34 
 
 		 509 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  50.34 
 
 		 509 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  48.57 
 
 		 560 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  47.5 
 
 		 528 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  47.15 
 
 		 523 aa  278  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  49.67 
 
 		 525 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  46.82 
 
 		 513 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  46.03 
 
 		 520 aa  277  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  47.44 
 
 		 506 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  47.63 
 
 		 527 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  47.94 
 
 		 560 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  47.19 
 
 		 528 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  46.86 
 
 		 516 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  46.67 
 
 		 513 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  46.67 
 
 		 513 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  45.89 
 
 		 513 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  46.03 
 
 		 517 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  47.15 
 
 		 523 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  48.41 
 
 		 525 aa  275  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>