More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0069 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  78.69 
 
 		 305 aa  501  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  79.34 
 
 		 305 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  76.72 
 
 		 305 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  69.51 
 
 		 305 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  67.54 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  66.78 
 
 		 302 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  65.36 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  64.71 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  65.36 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  65.03 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  64.05 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  57.14 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  57.14 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  56.83 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  54.49 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  54.17 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.18 
 
 		 511 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  52.85 
 
 		 312 aa  310  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  54.66 
 
 		 517 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  52 
 
 		 520 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.41 
 
 		 511 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  51.38 
 
 		 520 aa  299  5e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  51.11 
 
 		 533 aa  298  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  53.7 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.59 
 
 		 516 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  50 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  50.48 
 
 		 560 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  51.27 
 
 		 516 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.96 
 
 		 516 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  53.14 
 
 		 517 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  50.8 
 
 		 508 aa  295  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  48.3 
 
 		 528 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  50.79 
 
 		 512 aa  295  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  52.5 
 
 		 520 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  50 
 
 		 517 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  50.79 
 
 		 560 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  51.38 
 
 		 526 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  47.37 
 
 		 528 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  50.8 
 
 		 509 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  50.8 
 
 		 509 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.79 
 
 		 510 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  51.76 
 
 		 512 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  49.21 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  47.99 
 
 		 528 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  48.88 
 
 		 507 aa  292  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  50.64 
 
 		 501 aa  292  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  52.38 
 
 		 531 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  50.64 
 
 		 501 aa  292  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.59 
 
 		 512 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  50.16 
 
 		 515 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.09 
 
 		 513 aa  291  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  291  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  50.16 
 
 		 515 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  50.16 
 
 		 515 aa  291  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.39 
 
 		 539 aa  291  7e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  291  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  52.24 
 
 		 513 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  50.16 
 
 		 515 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  47.84 
 
 		 528 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  51.43 
 
 		 516 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  49.52 
 
 		 511 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  51.91 
 
 		 512 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  48.24 
 
 		 510 aa  289  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  49.36 
 
 		 520 aa  289  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50.48 
 
 		 510 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  49.52 
 
 		 512 aa  288  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  50 
 
 		 511 aa  288  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  49.39 
 
 		 537 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  48.46 
 
 		 528 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  48.46 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  48.73 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  49.52 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  48.57 
 
 		 520 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  51.22 
 
 		 538 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  48.74 
 
 		 512 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  51.27 
 
 		 512 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  47.37 
 
 		 575 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  50.16 
 
 		 517 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  50.77 
 
 		 533 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  50.79 
 
 		 510 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.8 
 
 		 533 aa  285  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  49.4 
 
 		 540 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  50.8 
 
 		 510 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  47.84 
 
 		 542 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  50.32 
 
 		 509 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  47.84 
 
 		 542 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  49.54 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.52 
 
 		 510 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  47.22 
 
 		 542 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  47.68 
 
 		 528 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  47.55 
 
 		 548 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  48.62 
 
 		 523 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  50.91 
 
 		 538 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  47.3 
 
 		 513 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  48.16 
 
 		 575 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  48.24 
 
 		 517 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>