40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0008 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  73.13 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  56.92 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  61.9 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  55.56 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  41.27 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  45 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  41.94 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  39.34 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  35.71 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 115 aa  42  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  34.78 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  31.67 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>