59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0552 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 79 aa  149  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  84.06 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  72.86 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  88.24 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  61.67 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  50 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  43.55 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  39.34 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  41.43 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  40.3 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  35.14 
 
 		 121 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 67 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  39.06 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  38.81 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  45.28 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>