More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1687 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  76.19 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  82.14 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  82.14 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  82.14 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  69.35 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  65.57 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  75 
 
 		 66 aa  87  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  73.58 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  65.57 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  71.93 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  63.93 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  63.49 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  63.49 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  69.64 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  69.64 
 
 		 66 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  65.57 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  63.93 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  73.21 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  73.21 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  67.27 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  68.52 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  68.52 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  65.08 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  66.07 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  60.71 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  58.33 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  49.28 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  47.89 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  60.71 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  55.36 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  57.41 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  58.18 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  49.25 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  48.44 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  47.83 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>