31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2246 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  75 
 
 
67 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  73.13 
 
 
67 aa  99.4  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  70.31 
 
 
67 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  68.75 
 
 
66 aa  95.9  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  49.18 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  34.38 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  56.06 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  40.32 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  37.5 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  35.59 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  35.48 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 
74 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 
74 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 
74 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  33.9 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  40 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>