93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0716 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 
71 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  85.92 
 
 
71 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  85.92 
 
 
71 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  85.29 
 
 
68 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  70.31 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  50.79 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  41.27 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  42.19 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  40.62 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  46.97 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  42.42 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  39.06 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  38.81 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  41.94 
 
 
71 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.14 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  44.07 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.86 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  37.5 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  40.32 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  39.39 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  39.39 
 
 
67 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  41.94 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  46.03 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  44.62 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  39.39 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40.62 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  37.1 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  43.75 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  35.38 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  37.5 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 
68 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  34.92 
 
 
76 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 
74 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
74 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  36.92 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  35 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  37.1 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 
68 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  35.48 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  46.88 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  34.92 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  45.31 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  31.25 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  31.25 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  32.81 
 
 
63 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  31.82 
 
 
66 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85685  predicted protein  40.32 
 
 
120 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>