80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2299 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 68 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  81.54 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  61.9 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  66.15 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  69.23 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  67.69 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  44.78 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  46.88 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  52.83 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  43.55 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.33 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.28 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  39.29 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  49.06 
 
 		 57 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  45.65 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 74 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 68 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>